長榮海運高雄貨櫃場第四貨櫃中心的115-117號專用碼頭，與第五貨櫃中心的79-81號專用碼頭於5月30日起獲高雄關稅局批准實施「全面自主管理」作業。

長榮海運實施自主管理後，據5月17日完成修訂的海關徵收規費規則，該公司將可享有貨櫃加封費減半之優惠，由原先的每次徵收100元降低為50元，可大幅減低業者的成本負擔；另外，單一作業窗口的推行，更提供貨主便利的全方位交領貨櫃服務。

目前長榮集團中獲准實施「全面自主管理」作業的公司還有長榮貨櫃台中集散站、汐止集散站，及立榮海運台中貨櫃場的32-33號專用碼頭，而亞洲地區最大的內陸貨櫃集散站─長榮貨櫃桃園場，也已向桃園關稅局遞件申請實施該項制度，預計短期內也會正式獲准實施，提供客戶更高品質的「一條龍式」運送服務。